燃烧石化燃料来行驶汽车、提供家用暖气及运转工厂机器，都会释放二氧化碳，这是造成温室效应、导致全球暖化的主要气体之一。另一方面，植物会随着生长而吸收二氧化碳，而且燃烧生质燃料比石化燃料释放更少的二氧化碳。因此，使用生质燃料对环境具有整体性的好处。此外，因为它们不含硫，所以生质燃料并不会释放像二氧化硫这种造成酸雨的主要前驱物质。

美国已经采用生质柴油为生质燃料，目前全美共有65家生产生质柴油的工厂。这种替代燃料在全国50州的公共加油站与其他来源都可以取得。